L’institut du zoo de Genomes ‘s roo san diego pour la recherche en conservation

Bien que le séquençage de l’ensemble des informations génétiques d’une espèce – son génome – existe depuis longtemps et que le génome humain ait été décrit en 2003, nous sommes encore à l’aube du domaine de la biologie du génome. Les coûts continuent de baisser pour le séquençage du génome, des améliorations continuent à être apportées au processus d’assemblage des informations génomiques révélant la base de l’hérédité d’une espèce, et de nouveaux outils de calcul pour stocker et analyser les grandes quantités de données impliquées dans le processus. et appliqué. Toute cette activité produit une manière différente de voir la vie et son évolution et, plus important encore, de fournir des idées qui peuvent nous aider à devenir de meilleurs intendants de la biodiversité.


San Diego L’objectif principal de Zoo Global est de sauver des espèces. Pour ce faire, nous développons et appliquons les connaissances scientifiques nécessaires pour mieux comprendre l’histoire des espèces, leurs spécialisations et les exigences en matière de bien-être et de reproduction. L’utilisation des données génomiques produit déjà un éventail d’avantages en matière de conservation qui peuvent aider à faire des choix plus éclairés sur les stratégies de conservation des espèces.

Par exemple, le condor californien est la première espèce menacée pour laquelle la gestion génétique – pour préserver le patrimoine génétique de l’espèce – est basée sur génome entier séquences des fondateurs de la population survivante. D’autres espèces suivront sûrement, car la capacité de mesurer directement et de surveiller la variation à l’échelle du génome fournit des méthodes avec moins d’hypothèses sur le fonctionnement de l’hérédité, puisque nous pouvons maintenant le décrire avec plus de précision.

Notre implication précoce dans le génome recherche Cela est dû en partie à la création du Frozen Zoo® par SDZG, et aux perspectives qui ont engendré son développement continu. Les milliers de surgelés viables cultures cellulaires (et d’autres biomatériaux) constituent une ressource incomparable pour les recherches biologiques de pointe, et constituent la partie principale d’une collection reconnue et bien documentée de grande renommée.

Nous avons fourni des échantillons d’ADN de vertébrés provenant de tissus congelés, des échantillons de sang et des cultures cellulaires pour plus de cinquante entiers séquençage du génome études d’une diversité d’espèces, un accomplissement sans égal. Ces matériaux permettent la meilleure qualité efforts de séquençage du génome, parce que nous pouvons obtenir de l’ADN de haut poids moléculaire lorsque nous établissons et développons des cultures cellulaires. Le Frozen Zoo® peut également contribuer de manière significative à l’identification de gènes et d’autres caractéristiques génétiques du génome en obtenant les séquences transcrites de génomes à partir de cultures cellulaires. Ces possibilités ajoutent une autre dimension à l’utilité de notre incroyable Frozen Zoo®.

Notre implication dans le projet Genome 10K, démarré en 2009 avec l’objectif ambitieux de séquencer les génomes de 10 000 espèces de vertébrés, a contribué au séquençage de nombreuses espèces de préservation préoccupation. La communauté de scientifiques Genome 10K constitue une collaboration internationale qui partage des échantillons et des informations, et a encouragé d’autres projets génomiques comparatifs complets pour les arthropodes et les invertébrés.

Le projet Genome 10K comprenait la première séquence du génome entier de l’éléphant de Swazi, la matriarche du troupeau du San Diego Zoo Safari Park. Le séquençage de son génome en tant que représentant d’une branche précoce de l’arbre de vie des mammifères a contribué au projet sur le génome humain. Il a également confirmé qu’il existe deux espèces distinctes d’éléphants d’Afrique (l’une vivant dans les savanes et l’autre dans les forêts), a clarifié leur temps de divergence d’un ancêtre commun et a identifié que par le passé, certains croisements entre eux se sont produits.

En outre, le premier gorille des plaines occidentales complète séquence du génome était de Kamilah, une femme au Safari Park. Sa séquence génomique a contribué à des études montrant que l’évolution rapide des récepteurs du goût a eu lieu chez les gorilles. Reconnaissant que des plantes contenant des composés toxiques sont présentes dans l’environnement du gorille, il a été suggéré que les mécanismes entraînant l’ingestion de plantes nuisibles présentent un avantage de survie. Cette connaissance peut faciliter l’étude des régimes de gorilles dans la nature.

Une autruche sud-africaine, un échidné à bec court et un tatou à trois bandes dans les collections du SDZG figurent également sur la liste des premières en matière de séquençage du génome. Beaucoup d’autres sont à venir alors que nous unissons nos forces avec d’autres efforts de séquençage génomique comparative à grande échelle.